内贸集装箱运输管理机制不健全
1缺乏有效的理货机制外贸集装箱运输在海关体系的严格要求和管理下，其理货机制是很完善的。但内贸集装箱运输却根本没有理货这个程序。理货机制的缺失带来了几个严重的问题：
A.出现货损的法律空白。由于没有理货机制，货主、港口、收货人往往会由于某种原因造成的货物缺失而产生争议，但却没有有效的文件来证明或澄清。
B.不能对危险品进行有效监控。在没有理货监督的条件下，部分货主就可以不报、瞒报危险品，或者夹带危险品，从而为运输安全带来了严重隐患，极大地威胁到人民生命财产的安全。
C.内贸集装箱超载现象严重。货主为了节省运费，主观上希望最.大限度地利用集装箱的空间。由于内贸集装箱货物种类繁多，甚至大量的建材、焦炭以及粮食都采用集装箱运输，因此就很容易造成内贸集装箱的严重超重，目前这种现象在我国港口普遍存在，但由于竞争因素大多采取忍让的态度。
港口价格在集装箱运输的地位与关系
（1）我国港口价格稳定，上下波动小
我国集装箱港口收费标准，自1992年4月1日颁布，20英尺集装箱装卸包干费为243．5元；1994年1月调整，20英尺集装箱装卸包千费为365．3元。从表面上看，这样收费增长了50％，曲靖到上海集装箱运输，但对船公司而言，因运费是以美元计收的，考虑到汇率变动情况，实际并未多支出。如SCT（上海集装箱码头有限公司）费率虽然比部定费率高，但有的船公司以“SCT附加费”名义向货主计收了每20英尺箱15美元，40英尺箱22．5美元。可见，对船公司来讲收运费是美元的船公司来讲，上海集装箱运输，无论以部费率还是以SCT费率标准向码头支付费用，实际上并未多支出。1997年6月起执行新的收费规则，取消过磅费费目，将过磅费的费用分摊到集装箱上，20英尺集装箱装卸包干费为370元。从上面的叙述可以看出10多年来，船公司在港口支付与集装箱作业相关的费用几乎没有增长。从进出口国内贸易方来讲，与外方结算的，绝大多数是美元，支付船公司运费也是美元，所以交通部调整的港口费用对货主来讲，影响不是很大。
（2）集装箱运价不稳定，玉溪到上海集装箱运输，上下幅度大
航运界的竞争十分激烈，船公司的运价，变化莫测。去年上半年的中日航线，以20英尺集装箱运价为例，有的船公司为180美元左右，而激烈的竞争使中日航线运价一路暴跌，最.低的甚至为120美元，早已跌进成本价，跌幅令人触目惊心。中日航线运价最.低时仅为20世纪90年代初期的20％。船公司为生存、为发展而削价竞争，其结果是一些规模小的船公司退出航运市场。
（3）港口价格在集装箱运输价格中的比重
在正常的情况下，港口价格占集装箱运输价格的比重并不大，而作为港口中主要环节的码头，昭通到上海集装箱运输，如 SCT的价格并不高，远低于香港、日本及欧美等码头。运价与路程相关，远洋运输运价高，港口费用占的比重小，对船公司的影响小一点；近洋运输运价低，港口费用占的比重大，影响必然大一些。
但是对于港口自身而言，不论是远洋船只还是近洋船只靠泊作业，装卸成本是一样的。但假如集装箱运价恢复到20世纪90年代初水平，每航次有七八成箱量，可能没有人会对长期几乎未变的港口价格提出批评。
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