在共聚焦系统中选择二向色镜可以获得更好的效果
随着更新、更强的激光器的出现，利用增透膜来增加透过率就显得没有必要了。然而，这些光学器件采用最.大反射的干涉涂层以避免热损伤，增透膜将因此减少表面反射。这些反射光不能被反射进入激光器的共振腔。因此，这些光件被设计用于入射角(AOI)在3.5度到5度之间。二极管激光器在热身之后所发射的光的波长会有轻微的变化，紫外滤光片490，因此，我们建议为这些光源配备20-25nm宽的纯化滤波片。在共聚焦系统和普通荧光显微系统中，为了获得较好的平面平整度，紫外滤光片 种类，它们必须克服波前像差。虽然两种系统的波前像差都控制在每英寸一个波的范围内，但在共聚焦系统中选择二向色镜显然可以获得更好的效果。
由于对孔径的独特的布置，共聚焦显微镜探测.器所提供的图像对应于一个薄的光学切片或是样品的截面。例如，一个几毫米厚的样品在焦平面处沿z轴降至少于微米。
共聚焦处的光照场通过一个被称为针孔的孔径所限制。视场同样也受到一个针孔的限制，针孔的位置是相对于第.一个孔径与照射点共轭的像平面上。这种共聚焦配置的结果就是降低了对散焦光的探测，从而通过减少成像容积来增加信噪比。
Marvin Minsky首先设计了共聚焦显微镜并在1957年的一份专利中描述了一个通过移动照射光束平台来实现的。从样品发来的调制光被送往光电管用示波器观察。光照射及随后的探测是通逐点地过移动平台来实现的。Minsky的极具原创性的构想最终彻底改变了显微镜。
Minsky的专利被通过的时候，紫外滤光片，还是存在有几个技术难点。由于限制孔径，他的系统需要非常强的光源。鉴于由针孔损失的光强，在当时激光并不存在，并且也没有其他足够强的光源来激发荧光。在那时候Minsky使用的是长期持久的示波器做观测，因此没有办法如实记录图像。导致其他发明者对这一特殊的显微镜做进一步的发展成为对普通研究者的有效工具。
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