内贸单证体系不完善
目前，内贸集装箱运输体系存在着严重的单证体系不完善的问题，主要表现为：不同的港口有着不同的单证，不同的船公司其单证也不一致。内贸集装箱运输价格体系不健全：交通部在内贸集装箱发展初期制定了内贸港口有关收费的规则，明确规定了港口对于内贸集装箱的收费标准。但是，这一标准严重低于外贸，基本上是外贸集装箱相关收费的一半。但随着内贸集装箱运输的发展这样的价格机制已成为了内贸集装箱发展的制约因素。同时由于内贸集装箱运价没有一个有效的监督机制，船公司之间在同一航线上的价格恶性竞争，也影响了内贸集装箱运输市场的健康发展。
关于铁路集装箱运输发展的研究
铁路集装箱运输本身是一个先进的运输方式，集装箱运输，是现代物流业的重要组成部分，随着中国经济发展进入新常态和“一带一路”战略的实施，特别是铁路建设发展和铁路改革政企分开，上海到合肥集装箱运输，铁路集装箱运输面临着重要的发展机遇，将成为中国铁路货运发展的重要战略方向，也是中国铁路市场化转型的重要标志。
关于物流业的发展。2009 年国务院发布了《物流业调整和振兴计划》，2014年9月12日发布了《物流业发展中长期规划》，把物流业定位于支撑国民经济发展的基础性、战略性产业。以服务电商为主的快递业保持快速增长。2014 年业务件量达140 亿件，同比增长52%，中国首.次超过美国成为世界快递业第.一大国。物流市场资本和技术双轮驱动，市场主体趋于集中；电商物流、快递快运、物流地产、冷链物流势、运输价格等系列因素对运量有很大影响。2015 年的铁路集装箱运量占到铁路总运量的2.7%，周转量占到5.48%。
中国铁路集装箱国际联运情况。从2011 年3月份中欧班列开始，上海到台州集装箱运输，到2015 年年底有共开行班列1070 列，回程班列是207 列。回程班列的90% 都是2015 年开的，上海到衢州集装箱运输，说明我们这几年在这方面的工作已经取得了一些成效。铁路集装箱海铁联运的情况。铁路集装箱海铁联运现在形成了三大通道，一个是大连、营口到东北地区的通道；一个是天津到华北、西北地区的通道；第三就是连云港、青岛港通过新亚洲大陆桥的通道。营口港因为硬件设施衔接得较好，再加上好的政策，这几年搭上了中欧专列“一带一路”的车，营口港的铁路集装箱海铁联运超过了大连港。
在管理体制上，铁路集装箱管理经过了几个发展阶段。从一开始的铁道部运输局管理到集装箱运输中心管等细分市场成为投资热点。还有平台整合、产业融合，包括阿里巴巴在全国的布点等。
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